Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SCAPQ12770 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SCAPQ12770 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SCAPQ12770 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SCAPQ12770 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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