Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms