Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms