Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNA1Q09470 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms