Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms