Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB2Q08289 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms