Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms