Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms