Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms