Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms