Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms