Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRG1Q02297 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRG1Q02297 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms