Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms