Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms