Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms