Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSF1Q00613 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms