Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX6P78412 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX6P78412 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms