Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKP1P63208 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKP1P63208 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms