Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-24P63145 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-24P63145 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms