Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4BP1P59074 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms