Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP4P57796 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP4P57796 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP4P57796 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP4P57796 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP4P57796 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP4P57796 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms