Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms