Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF3P57682 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF3P57682 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms