Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK1P57059 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK1P57059 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK1P57059 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK1P57059 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK1P57059 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms