Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52P55327 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52P55327 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52P55327 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms