Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms