Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAPAP54920 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAPAP54920 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAPAP54920 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAPAP54920 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAPAP54920 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms