Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A2P52657 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms