Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms