Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2AP48426 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms