Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms