Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCAMP43121 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCAMP43121 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCAMP43121 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCAMP43121 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms