Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPOP42166 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPOP42166 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms