Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL9P32969 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL9P32969 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL9P32969 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL9P32969 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL9P32969 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms