Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG3P32926 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG3P32926 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG3P32926 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms