Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC27P30260 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms