Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA1P29973 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms