Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms