Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD34P28906 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD34P28906 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD34P28906 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD34P28906 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms