Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
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PTPRMP28827 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRMP28827 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
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