Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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