Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBB3P26998 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRYBB3P26998 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms