Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHMLP26374 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMLP26374 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms