Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPCAMP16422 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms