Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms