Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD8P13378 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD8P13378 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD8P13378 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD8P13378 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms