Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms