Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms