Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHGAP10645 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHGAP10645 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHGAP10645 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHGAP10645 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHGAP10645 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms