Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms